Wat gaan we doen?
Zojuist heb ik een team opgericht om een bijdrage te leveren aan het distributed computing project folding@home.
Distri-watte?
Mocht je het niet kennen: distributed computing is een techniek waarbij de taken niet door één enkele computer worden uitgevoerd, maar door een verzameling van genetwerkte computers en lijkt daarmee enigszins op een computer cluster. De verzameling computers kan bestaan uit machines in één ruimte, of uit computers die over de hele wereld zijn verspreid, waarbij gebruik wordt gemaakt van conventionele netwerktechnieken en internet. Het idee is om een grotere totale rekenkracht (verwerkingscapaciteit) te verkrijgen door het combineren van de rekenkracht van de individuele computers. Wanneer in een netwerk zeer veel relatief eenvoudige computers beschikbaar zijn kan de beschikbare rekenkracht aanzienlijke proporties aannemen, vergelijkbaar met extreem dure supercomputers.
Distributed computing is met name geschikt voor rekentaken waarbij de hoeveelheid data die tussen de cliënt en de server moet worden verstuurd erg klein is in verhouding tot de rekenkracht die nodig is om de data te verwerken. De rekenkracht die gebruikt wordt, is slechts die rekenkracht die op dat moment onbenut is; het proces heeft de laagst mogelijke prioriteit. Kort gezegd: het netwerk wordt nauwelijks belast, en de gebruiker heeft geen last van een tragere computer of werkstation.
Folding@Home? Wat gaan we vouwen dan?
Folding@Home is een distributed computing project, geïnitieerd door Standford University, dat het vouwen van eiwitten, het misvouwen van eiwitten, de samenvoeging en aanverwante ziektes bestudeert. Ze gebruiken nieuwe computertechnieken en op grote schaal 'distributed computing'-methodes om tijdsperiodes die duizenden tot miljoenen keren groter zijn dan tot nu toe bereikt te simuleren. Dit heeft ons in staat gesteld voor het eerst het vouwen na te bootsen, en om ons nu te richten op het onderzoeken van aan het vouwen gerelateerde ziektes. Denk hierbij aan alzheimer, [..], parkinson en BSE. (uit: http://folding.stanford.edu/dutch/)
Momenteel staat het aantal processoren die actief aan het rekenen zijn op ruim 200.000 en doen er ongeveer 50.000 teams mee. Natuurlijk is het leuk als ons team hoog in de rankings komt. Zelfs als maar 10% van alle leden meedoet, hebben we toch een leuk team van zo'n 100 processoren.
Hoe kun je met het phpBB.nl-team meedoen?
Download de software: http://folding.stanford.edu/download.html
Installeer de software en vul je gebruikersnaam in. Het is handig om je forum-gebruikersnaam in te vullen. Zo kunnen we elkaar herkennen.
Vul ook het teamnummer in. Voor phpBB.nl is dit 65805
Omdat het programma iets vertraagd reageert op benodigde processorcapaciteit voor de gebruiker, raad ik aan om bij het tabblad Geavanceerd de maximaal benutte capaciteit op 80% te zetten. Uit eigen ervaring kan ik melden dat je in dit geval als gebruiker niets merkt van het programma, tenzij er zéér zware toepassingen als schietspellen of geluidsbewerking gedraaid worden.
Verder zal de rest van de instellingen waarschijnlijk goed staan, maar misschien is het nuttig om alles toch door te nemen.
Nuttige links
Als je wilt kijken hoe je het in ons team doet, kijk dan op:
http://vspx27.stanford.edu/cgi-bin/main ... mnum=65805
Je kan jezelf overigens pas in de statistieken terugvinden wanneer je meer dan 0 punten hebt. Als je er nog niet meteen instaat dan kan dat dus kloppen.
en hier een grafische weergave (zgn. radar) van de snelheid waarmee wij en de tien teams vóór ons vouwen, zodat je goed kunt zien hoe snél we ze inhalen
http://fahstats.com/tr.php?t=65805
Ook de Project Summary op deze site kan interessant zijn; hier vind je een overzicht van alle eiwitten in behandeling. Ook kan je zien wat jouw eiwitje oplevert en wat de deadlines zijn: http://fah-web.stanford.edu/psummary.html
Als je problemen tegenkomt of vragen hebt waarop wij zelf geen antword kunnen geven, kun je terecht op het Internationale Folding Forum.
De FAQ Folding@Home van Wetenschapsforum.nl. Alles wat je moet weten vóórdat je begint, nuttige weetjes als je net begonnen bent en interessante achtergrondvragen.
Mochten jullie meer informatie willen, stel je vragen gerust. Op de meesten kan ik inmiddels wel een antwoord geven.
--------------------------------------------
BOINC - project
Gelijklopend project met meerder functies en een beter programma
id : 7828
http://einstein.phys.uwm.edu/team_join_form.php?id=7828
voor meer informatie zie :
http://boinc.berkeley.edu/
Auteur aangepast van mijzelf naar SFB.
- ElbertF
Ik zit nu aan 30/20000 :s op een halve dag ?
De reden: van 100% CPU-load wordt mijn processor én 10 graden warmer, bovenop zijn al niet normale temperatuur, én de fan gaat nog eens dubbel zo hard draaien, bovenop het al vreselijke lawaai.
Ik was er niet eens bij 
